溃疡性结肠炎（UC）是一种致残性疾病，发病率高，严重影响患者的生活质量。溃疡性结肠炎的患者将经历缓解期和急性发作期。它是一种影响结肠的疾病，以排便习惯改变、便血、腹痛、体重减轻和贫血为特征。西方国家中UC的患病率约为200例/100,000人，而中国或日本的患病率则为50-60例/100,000人。西方国家中UC的发病率高于东方国家。但在过去的十年中，东方国家的患病率有所上升。尚不清楚UC的病因；认为UC与大肠粘膜的自身免疫密切相关。UC可见于任何年龄段，但发病率高峰年龄为20至30岁。如果管理不当，还会影响患者的社会和心理健康。目前， “治愈”这种疾病的唯一方法为全结肠切除术，但这一方法却存在风险和并发症。通过对UC中细胞因子和细胞内信使通路的了解发现了Janus激酶（JAK）的作用，这是目前研究的热点之一。  

克罗恩病(CD)是一种引起胃肠道慢性炎症的炎症性肠病，其特点是炎症的复发和缓解，呈渐进的。与日本和中国的20/10万的患发病率相比，它在西方国家的发病率更高，约为100/10万。女性的发病率略高，在20 - 40岁之间发病率最高。与只影响结肠的溃疡性结肠炎不同，克罗恩病可影响从口腔到肛门的胃肠道的任何部分，最常影响回肠末端和结肠近端，其会导致腹痛、腹胀、腹泻、呕吐和体重减轻等各种消化道症状，目前还没有治愈克罗恩病的方法，它的治疗原则旨在阻止疾病的发展，诱导和维持缓解病情，同时预防手术和疾病并发症。新的治疗方法侧重于研究抑制或改变T细胞的分化。  

斑秃（AA）是一种自身免疫性疾病，是体内T细胞攻击毛囊而导致的暂时的非瘢痕性脱发，这种脱发可能持续几周至几十年。斑秃通常表现为单个或多个区域界限明显的斑片状脱发。众所周知，斑秃患者抑郁症的发病率较高。全球约2%的人患有AA。在中国，AA发病率为0.27%，约有400万人患有AA。70-80%的AA患者年龄在40岁或40岁以下，无性别或种族差异。它被认为是由压力、紊乱的免疫系统和遗传易感性共同作用的结果。病程越长，预后越差。目前尚无治疗方法可获得永久性的毛发再生。也有越来越多的临床证据表明， JAK抑制剂可能是斑秃的潜在治疗方法。